El municipio de Paipa se encuentra dentro de la provincia de Tundama, localizada al Noreste del departamento de Boyacá. Limita por el norte con el departamento de Santander, por el oriente con los municipios de Tibasosa y Duitama, por el sur con Firavitoba y por el occidente con Sotaquirá y Tuta.
La distancia en línea recta entre Paipa (Boyacá) y Bogotá (Cundinamarca) es de 169,91 km, pero la distancia en ruta es de 196 kilómetros.
Se tardan 3 horas 52 minutos en ir de Paipa a Bogotá en auto, lo que requeriría un consumo de 12 litros de combustible. El gasto de este viaje sería de unos 37.435,18 pesos.